RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 KRT222Q8N1A0 295 aa20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 KINO60870 393 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 DDAH1O94760 285 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 SLF2Q8IX21 1173 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 PLCG2P16885 1265 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC192P0DO97 292 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP5P59047 1200 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 MYH6P13533 1939 aa20.45■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 MYH1P12882 1939 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 GDF11O95390 407 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SYCP1Q15431 976 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 WASF1Q92558 559 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB9Q96C00 473 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 LAMB1P07942 1786 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KLRF2D3W0D1 207 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SCG2P13521 617 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SLC16A2P36021 539 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 DGKHQ86XP1 1220 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.45■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF202O95125 648 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SHMT1P34896 483 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 MTA3Q9BTC8 594 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 NID2Q14112 1375 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PSMD14O00487 310 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 YEATS4O95619 227 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CDC25AP30304 524 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KIF18AQ8NI77 898 aa20.44■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 COL4A5P29400 1685 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 JAG1P78504 1218 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 UIMC1Q96RL1 719 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CBX8Q9HC52 389 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP100Q494V2 611 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CALM1P0DP23 149 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CALM2P0DP24 149 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CALM3P0DP25 149 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 GABPAQ06546 454 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KRT2P35908 639 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KCTD1Q719H9 257 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CASP1P29466 404 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SNAP25P60880 206 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 SPC24Q8NBT2 197 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 MCM7P33993 719 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PNOCQ13519 176 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 LONRF3Q496Y0 759 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 EPSTI1Q96J88 318 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PIGSQ96S52 555 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 GRM4Q14833 912 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 KIF5BP33176 963 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ATL3Q6DD88 541 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 STAMQ92783 540 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 EGFRP00533 1210 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF165P49910 485 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 COA7Q96BR5 231 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 CSRNP2Q9H175 543 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4D-204ENST00000358923 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 SYKP43405 635 aa20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RCAN1P53805 252 aa20.39■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms