RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 MTX1Q13505 466 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF15Q66K64 600 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PNMA1Q8ND90 353 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CSRNP2Q9H175 543 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TERF1P54274 439 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ARID5AQ03989 594 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CUL4AQ13619 759 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LIN9Q5TKA1 542 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TIGD1Q96MW7 591 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 VPS16Q9H269 839 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ADORA1P30542 326 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NEK8Q86SG6 692 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TTC14Q96N46 770 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 H0YCG3 227 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CHMP2AO43633 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OR52Z1P0C646 297 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 HDXQ7Z353 690 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NOX5Q96PH1 765 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CRB1P82279 1406 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ERFEQ4G0M1 354 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PALLDQ8WX93 1383 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PRG0 241 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 H7C1D1 291 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BCRP11274 1271 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC169A6NNP5 214 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2MP0CAP2 368 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PNOCQ13519 176 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5DP30049 168 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYCT1Q8N699 235 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PIGBQ92521 554 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 AK8Q96MA6 479 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 AZI2Q9H6S1 392 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 USH1GQ495M9 461 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KLRF2D3W0D1 207 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYL1P05976 194 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KRT5P13647 590 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TCP10Q12799 353 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GNPTABQ3T906 1256 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DNM2P50570 870 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.4 ms