RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L11	C9JVI0	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L18	D6R9N7	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L22	D6RA61	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L19	D6RCP7	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L20	D6RJB6	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L24	Q0WX57	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	DCTPP1	Q9H773	170 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	MAPK4	P31152	587 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	PLXNB2	O15031	1838 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	HMGCR	P04035	888 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ERVK-9	P63128	1117 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ERVK-24	P63145	666 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	GJD2	Q9UKL4	321 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	SGPL1	O95470	568 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	VCAM1	P19320	739 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	ACER1	Q8TDN7	264 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		32.56	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	SEPT2	Q15019	361 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	PRKAB2	O43741	272 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	GUCY1A2	P33402	732 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	CCNA1	P78396	465 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2D6	P10635	497 aa		32.53	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		32.53	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	LBX2	Q6XYB7	198 aa		32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	DEFB118	Q96PH6	123 aa		32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		32.52	■■■□□ 2.8
LYNX1-208	ENST00000615007	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	EVX2	Q03828	476 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	C12orf60	Q5U649	245 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC17	Q96LX7	622 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	SH2D4A	Q9H788	454 aa		32.51	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007		Q3C1V9	767 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	GPR142	Q7Z601	462 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	RPTOR	Q8N122	1335 aa		32.5	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L12	C9JPN9	530 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L21	D6R901	530 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	PEX10	O60683	326 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2B6	P20813	491 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	DPF3	Q92784	378 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	PORCN	Q9H237	461 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	RGS2	P41220	211 aa		32.48	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIB2	Q92519	343 aa		32.48	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CHGB	P05060	677 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ICA1	Q05084	483 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	LPAR1	Q92633	364 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		32.47	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A1W2PRG0	241 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ERC2	O15083	957 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CDK8	P49336	464 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	APPBP2	Q92624	585 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	APBA2	Q99767	749 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	CNMD	O75829	334 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	AKR1B1	P15121	316 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	COG2	Q14746	738 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	MORN1	Q5T089	497 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	USP6NL	Q92738	828 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.44	■■■□□ 2.78

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