RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590695.2

MUM1-208, Transcript of melanoma associated antigen (mutated) 1, human

TSL 5

Gene MUM1, Length 2,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUM1-208	ENST00000590695	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	NUP98	P52948	1817 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	GOLGA1	Q92805	767 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	TEX33	O43247	280 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	MBD4	O95243	580 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	NLRP10	Q86W26	655 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ST5	P78524	1137 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RTN1	Q16799	776 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	OXER1	Q8TDS5	423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	FUT8	Q9BYC5	575 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CSRNP2	Q9H175	543 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	PANX2	Q96RD6	677 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CCDC175	P0C221	793 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ATP2B1	P20020	1258 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	NEK11	Q8NG66	645 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	KANK3	Q6NY19	840 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	KRT23	Q9C075	422 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695		A0A0U1RQJ8	604 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	TXLNA	P40222	546 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	DEXI	O95424	95 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	RBL2	Q08999	1139 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MUM1-208	ENST00000590695	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	PRKAB2	O43741	272 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	WTAP	Q15007	396 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SPATA5	Q8NB90	893 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CABP5	Q9NP86	173 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695		A0A087X0B3	334 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	KCNQ4	P56696	695 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TOMM22	Q9NS69	142 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	PBX1	P40424	430 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TMEM51	Q9NW97	253 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	FGFR2	P21802	821 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SPATA1	Q5VX52	437 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	LPIN2	Q92539	896 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TULP2	O00295	520 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TRIM37	O94972	964 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	STX17	P56962	302 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CHMP4BP1	P59074	171 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CUL4B	Q13620	913 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	RASGRF1	Q13972	1273 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SHISA4	Q96DD7	197 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CHD4	Q14839	1912 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CCDC151	A5D8V7	595 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	CASP1	P29466	404 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	MAP3K12	Q12852	859 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	EPSTI1	Q96J88	318 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	FAM205C	A6NFA0	338 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	AFM	P43652	599 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	FANCB	Q8NB91	859 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MUM1-208	ENST00000590695	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		29.03	■■■□□ 2.24

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