RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533085.2

CENPCP1-201, Transcript of centromere protein C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CENPCP1, Length 2,578 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCP1-201ENST00000533085 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.3□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.3□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.3□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 MRS2Q9HD23 443 aa3.3□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 TLR6Q9Y2C9 796 aa3.29□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CENPCP1-201ENST00000533085 SV2BQ7L1I2 683 aa3.29□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 COPRSQ9NQ92 184 aa3.28□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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CENPCP1-201ENST00000533085 C19orf44Q9H6X5 657 aa3.27□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 ZSWIM5Q9P217 1185 aa3.27□□□□□ -1.89
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CENPCP1-201ENST00000533085 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.25□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 MINDY4BA8MYZ0 360 aa3.25□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 PF4P02776 101 aa3.25□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 ETF1P62495 437 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CENPCP1-201ENST00000533085 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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