RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497483.1

HDAC10-219, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 2

Gene HDAC10, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-219	ENST00000497483	SHISA4	Q96DD7	197 aa		29.85	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		29.85	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		29.85	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	GJB1	P08034	283 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	VCAM1	P19320	739 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	SEPT2	Q15019	361 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L15	C9J2P7	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L11	C9JVI0	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L18	D6R9N7	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L22	D6RA61	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L19	D6RCP7	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L20	D6RJB6	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	ELN	P15502	786 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L24	Q0WX57	530 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		29.83	■■■□□ 2.37
HDAC10-219	ENST00000497483		A0A0G2JMZ2	1700 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	INHA	P05111	366 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	GJA8	P48165	433 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ERVK-9	P63128	1117 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ERVK-24	P63145	666 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	APPBP2	Q92624	585 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	RNF208	Q9H0X6	261 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	GJD2	Q9UKL4	321 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	RLF	Q13129	1914 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	PARP14	Q460N5	1801 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L12	C9JPN9	530 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	USP17L21	D6R901	530 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	LBX2	Q6XYB7	198 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ERC2	O15083	957 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	MAPK4	P31152	587 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CCDC17	Q96LX7	622 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483		A0A1W2PRG0	241 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CTR9	Q6PD62	1173 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		29.79	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	PEX10	O60683	326 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CAPN2	P17655	700 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CDK8	P49336	464 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	OSBP2	Q969R2	916 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		29.77	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	HMGCR	P04035	888 aa		29.77	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	AKR1B1	P15121	316 aa		29.77	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		29.77	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
HDAC10-219	ENST00000497483	SMIM22	K7EJ46	135 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	MX1	P20591	662 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	AAMP	Q13685	434 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483		Q3C1V9	767 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	SBK1	Q52WX2	424 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	PORCN	Q9H237	461 aa		29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	CNMD	O75829	334 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	ICA1	Q05084	483 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	GCC1	Q96CN9	775 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	SH2D4A	Q9H788	454 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	GPAA1	O43292	621 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	GNAT2	P19087	354 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	CCNA1	P78396	465 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	LPAR1	Q92633	364 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	TMX2	Q9Y320	296 aa		29.74	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		29.73	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	SGPL1	O95470	568 aa		29.73	■■■□□ 2.35
HDAC10-219	ENST00000497483	GPR142	Q7Z601	462 aa		29.73	■■■□□ 2.35

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