RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 CAPN2P17655 700 aa32.12■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 USP17L24Q0WX57 530 aa32.12■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 KBTBD3Q8NAB2 608 aa32.12■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 TTC41PQ6P2S7 1318 aa32.11■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 PRKAB2O43741 272 aa32.11■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 SLFNL1Q499Z3 407 aa32.11■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 RNF208Q9H0X6 261 aa32.11■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 GUCY1A2P33402 732 aa32.1■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 GJA8P48165 433 aa32.1■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 TMEM179Q6ZVK1 233 aa32.1■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa32.1■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 CYP2D6P10635 497 aa32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 C12orf60Q5U649 245 aa32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ACER1Q8TDN7 264 aa32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ERC2O15083 957 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 INHAP05111 366 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ELNP15502 786 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 VCAM1P19320 739 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 MAPK4P31152 587 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 SEPT2Q15019 361 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 CCDC17Q96LX7 622 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 RBPJLQ9UBG7 517 aa32.08■■■□□ 2.73
ODC1-204ENST00000446285 ERVK-9P63128 1117 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 ERVK-24P63145 666 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 EVX2Q03828 476 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 SOCS4Q8WXH5 440 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 TXNRD2Q9NNW7 524 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 GJD2Q9UKL4 321 aa32.07■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 USP17L12C9JPN9 530 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 USP17L21D6R901 530 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CHGBP05060 677 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 APPBP2Q92624 585 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 SHISA4Q96DD7 197 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa32.06■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 GIMAP6Q6P9H5 292 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 LBX2Q6XYB7 198 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 SLC44A5Q8NCS7 719 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 DYNLL2Q96FJ2 89 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 UNC93B1Q9H1C4 597 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 HMGCRP04035 888 aa32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CCNA1P78396 465 aa32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 C16orf86Q6ZW13 317 aa32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 SH2D4AQ9H788 454 aa32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 PLXNB2O15031 1838 aa32.04■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 AAMPQ13685 434 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 TSHZ3Q63HK5 1081 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CRBNQ96SW2 442 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 NUDT12Q9BQG2 462 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 PAGR1Q9BTK6 254 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CDK8P49336 464 aa32.02■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 CTR9Q6PD62 1173 aa32.02■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
ODC1-204ENST00000446285 SGPL1O95470 568 aa32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 GNAT2P19087 354 aa32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 Q3C1V9 767 aa32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 LPAR1Q92633 364 aa32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 GCC1Q96CN9 775 aa32.01■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 A0A1W2PRG0 241 aa32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 AKR1B1P15121 316 aa32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 ICA1Q05084 483 aa32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 SBK1Q52WX2 424 aa32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa31.99■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 MX1P20591 662 aa31.99■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.99■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 PI4K2BQ8TCG2 481 aa31.99■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 OSBP2Q969R2 916 aa31.99■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 POTEEQ6S8J3 1075 aa31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 GPR142Q7Z601 462 aa31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 PORCNQ9H237 461 aa31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 HOXC10Q9NYD6 342 aa31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 TMX2Q9Y320 296 aa31.98■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 PEX10O60683 326 aa31.97■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 CNMDO75829 334 aa31.97■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.97■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 GSG1L2A8MUP6 293 aa31.96■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 GPAA1O43292 621 aa31.96■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 CYP2B6P20813 491 aa31.96■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 RGS2P41220 211 aa31.96■■■□□ 2.71
ODC1-204ENST00000446285 COG2Q14746 738 aa31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms