RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 ENC1O14682 589 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 SORBS3O60504 671 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PAGE1O75459 146 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CTSHP09668 335 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 SYN1P17600 705 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ITIH2P19823 946 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 STK35Q8TDR2 534 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 MRS2Q9HD23 443 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.1□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 GLDCP23378 1020 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 FYB2Q5VWT5 728 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 DIRC2Q96SL1 478 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TMPRSS2O15393 492 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 RECKO95980 971 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CELA3AP09093 270 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SULF2Q8IWU5 870 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 C20orf173Q96LM9 149 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SLC26A8Q96RN1 970 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CEP44Q9C0F1 390 aa5.09□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 BMP6P22004 513 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ID3Q02535 119 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 PDZD3Q86UT5 571 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 KCNB2Q92953 911 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CBX8Q9HC52 389 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 U3KQE9 123 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TCF3P15923 654 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LIG1P18858 919 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 NME2P22392 152 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ARNTP27540 789 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 GDNFP39905 211 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CLCN7P51798 805 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 RASIP1Q5U651 963 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LEFTY1O75610 366 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00310P59036 64 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 MAP3K11Q16584 847 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SV2BQ7L1I2 683 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CRELD1Q96HD1 420 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 USP31Q70CQ4 1352 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF862O60290 1169 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SRFP11831 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 NFIXQ14938 502 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 BACH2Q9BYV9 841 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 RAC2P15153 192 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 KCNN1Q92952 543 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 KRT82Q9NSB4 513 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SAMM50Q9Y512 469 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 F6X3S4 739 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 DISC1Q9NRI5 854 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 PSPNO60542 156 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LIG3P49916 1009 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 TTLL4Q14679 1199 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC14Q15048 493 aa5.03□□□□□ -1.6
CCDC82-202ENST00000423339 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms