RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 MTMR6Q9Y217 621 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 SHTN1A0MZ66 631 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS16Q9H269 839 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CTR9Q6PD62 1173 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 BACH1O14867 736 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 PFKFB2O60825 505 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR108Q9NPR9 543 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 B4DLN1 442 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ALDH1B1P30837 517 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 MLKLQ8NB16 471 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CIAO1O76071 339 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 USP28Q96RU2 1077 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 PLVAPQ9BX97 442 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CLTCL1P53675 1640 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCCQ00597 558 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE3CQ15386 1083 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP2AO43633 222 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R2P41236 205 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY7P51828 1080 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 STAMQ92783 540 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 TNKSO95271 1327 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCBQ8NB91 859 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP21A2P08686 494 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 USP40Q9NVE5 1235 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNCQ9H7C4 482 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MYZAPP0CAP1 466 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE4AQ14139 1066 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM6Q14566 821 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 POSTNQ15063 836 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS12O14924 1447 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP12P59046 1061 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ADALQ6DHV7 355 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP112Q8N8E3 955 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF75DP51815 510 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY9O60503 1353 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS22Q8NE09 1264 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 TEKT1Q969V4 418 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 UIMC1Q96RL1 719 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNQ4P56696 695 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 MSL1Q68DK7 614 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGBQ92521 554 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PAK1Q13153 545 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP10Q86W26 655 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CPXCR1Q8N123 301 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP27B1O15528 508 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP2B4P23634 1241 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM212AQ96EL1 285 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms