RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT23	Q9C075	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602		E7EWF7	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ORC4	O43929	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	FGR	P09769	529 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDK8	P49336	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	GABPA	Q06546	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ESR2	Q92731	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	YY1	P25490	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NF2	P35240	595 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63	2e-6	■□□□□ 10.6
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYH1	P12882	1939 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	RABEP1	Q15276	862 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602		B4E1Z4	1266 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRDM1	O75626	825 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCM5	P33992	734 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	EVX2	Q03828	476 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	NEDD4	P46934	1319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM4A	O75164	1064 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASA1	P20936	1047 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	SHMT1	P34896	483 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	TFAP4	Q01664	338 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF2C	Q99661	725 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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