RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 LTAP01374 205 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-204ENST00000460258 MT2AP02795 61 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-204ENST00000460258 UBE2G1P62253 170 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-204ENST00000460258 RAB24Q969Q5 203 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-204ENST00000460258 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.65□□□□□ -1.34
NOP56-204ENST00000460258 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 UBE2G2P60604 165 aa6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 Q8N377 158 aa6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.64□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 TEX46H3BTG2 121 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 FHITP49789 147 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 BLOC1S1P78537 153 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 IFITM2Q01629 132 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 ZNF726P1Q15940 193 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 TPPP3Q9BW30 176 aa6.63□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 CXorf1O96002 111 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 GATD1Q8NB37 220 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MRAP2Q96G30 205 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.62□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 KMT2DO14686 5537 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 RAB14P61106 215 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 Q6Q795 121 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 LINC00167Q96N53 147 aa6.61□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 MT1FP04733 61 aa6.6□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.6□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 SLC25A20O43772 301 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 TRGC1P0CF51 173 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 PMCHP20382 165 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 PRLHP81277 87 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 CLLU1Q5K131 121 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.59□□□□□ -1.35
NOP56-204ENST00000460258 A0A1B0GV50 99 aa6.58□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 I3L3M4 83 aa6.58□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 IFNA1P01562 189 aa6.58□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 C2orf82Q6UX34 121 aa6.58□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 MANBALQ9NQG1 85 aa6.58□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 GAGE10A6NGK3 116 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 FAM74A7A6NL05 159 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 ZNF727A8MUV8 499 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 IGLC6P0CF74 106 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 KIAA0087Q14695 138 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 C9orf92A6NGG3 77 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 CCL20P78556 96 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 GNG13Q9P2W3 67 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 FAM210AQ96ND0 272 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 PAGE4O60829 102 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 AKR1C3P42330 323 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 CST9LP1Q5W188 147 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 MED9Q9NWA0 146 aa6.54□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 PDE6DO43924 150 aa6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 KRTAP10-10P60014 251 aa6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NOP56-204ENST00000460258 RAB19A4D1S5 217 aa6.52□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.52□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.52□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 LINC00862A6NCI5 91 aa6.51□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 TMEM250H0YL14 139 aa6.51□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 PEA15Q15121 130 aa6.51□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 Q6ZUT4 128 aa6.51□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 SPRR4Q96PI1 79 aa6.51□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 F2Z2F3 143 aa6.5□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 UQCC3Q6UW78 93 aa6.5□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.5□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 C11orf52Q96A22 123 aa6.5□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 MDN1Q9NU22 5596 aa6.5□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 NDUFA5Q16718 116 aa6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 COMMD7Q86VX2 200 aa6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 BAGE2Q86Y30 109 aa6.49□□□□□ -1.37
NOP56-204ENST00000460258 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms