RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 LAMA4Q16363 1823 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 GLTPD2A6NH11 291 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 POTECB2RU33 542 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 APPP05067 770 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CYP21A2P08686 494 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SLURP2P0DP57 97 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 GNAT2P19087 354 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 HAND2P61296 217 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CTR9Q6PD62 1173 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 KCNB2Q92953 911 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NAPBQ9H115 298 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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CS-216ENST00000549221 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZMYM6O95789 1325 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CNTNAP1P78357 1384 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 USP17L12C9JPN9 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 USP17L21D6R901 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 PLCG2P16885 1265 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 USP5P45974 858 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TDO2P48775 406 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 PICALMQ13492 652 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CERS3Q8IU89 383 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-216ENST00000549221 IDI2Q9BXS1 227 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 INCENPQ9NQS7 918 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 LAMB1P07942 1786 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SIPA1L1O43166 1804 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 H7C1D1 291 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 PLCD1P51178 756 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 TCP10Q12799 353 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 IL17RAQ96F46 866 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 CPA1P15085 419 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 PPARAQ07869 468 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 SBK1Q52WX2 424 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 C12orf60Q5U649 245 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.7□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 HACL1Q9UJ83 578 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 NEDD4P46934 1319 aa9.7□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 E7EWF7 191 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 MCCP23508 829 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 EPHX2P34913 555 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 MMP14P50281 582 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 DLK2Q6UY11 383 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
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CS-216ENST00000549221 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 FAM196BA6NMK8 535 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 ENTPD3O75355 529 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 PRDM1O75626 825 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 POTEIP0CG38 1075 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 POTEJP0CG39 1038 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-216ENST00000549221 APLP1P51693 650 aa9.68□□□□□ -0.86
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