RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 B2RBV5 119 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LINC01387J3KSC0 135 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF862O60290 1169 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTR3BO95264 441 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYP11A1P05108 521 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTSBP07858 339 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MAOBP27338 520 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 POU4F3Q15319 338 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTPROQ16827 1216 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TTC6Q86TZ1 520 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TM9SF2Q99805 663 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CORO1BQ9BR76 489 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGF1RP08069 1367 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ESYT3A0FGR9 886 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FSCN2O14926 492 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDC45O75419 566 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ALBP02768 609 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GUCY2CP25092 1073 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARL4DP49703 201 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM260Q9NX78 707 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TM4SF5O14894 197 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DDAH1O94760 285 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EPXP11678 715 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SQSTM1Q13501 440 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 APPBP2Q92624 585 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LCE2BO14633 110 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DNAJA2O60884 412 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MTERF2Q49AM1 385 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HDXQ7Z353 690 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HOMER1Q86YM7 354 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 JMYQ8N9B5 988 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GMIPQ9P107 970 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LILRB5O75023 590 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ACRP10323 421 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LIG1P18858 919 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLCG1P19174 1290 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PDE3AQ14432 1141 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C2orf27AQ580R0 203 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPATC1Q76KD6 591 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ATG4CQ96DT6 458 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IFT57Q9NWB7 429 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H3BM21 787 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 M0R082 166 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MLECQ14165 292 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MSL1Q68DK7 614 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms