RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 C9orf85Q96MD7 179 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ESM1Q9NQ30 184 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CNFNQ9BYD5 112 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PROK2Q9HC23 129 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-30P01768 117 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PIP4P1Q86T03 277 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TET1Q8NFU7 2136 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ODF3BA8MYP8 253 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 MT-ATP8P03928 68 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 MBD6Q96DN6 1003 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 USF3Q68DE3 2245 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 LYPD6Q86Y78 171 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SIRPDQ9H106 197 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4-59P01825 116 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 EBI3Q14213 229 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TRIAP1O43715 76 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.81□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 GTF3C1Q12789 2109 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 A6NDX4 124 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 Q8N976 141 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CTSZQ9UBR2 303 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 K7EQG2 157 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PMAIP1Q13794 54 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF580Q9UK33 172 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CRYGDP07320 174 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 LELP1Q5T871 98 aa4.8□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 C10orf25Q5T742 122 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00205P59089 165 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SLURP1P55000 103 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 M0QY20 66 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 OBSL1O75147 1896 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PRO0628Q9UI54 55 aa4.79□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 A0A096LPF7 62 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PRYO14603 147 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WZ39 114 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 BRI3O95415 125 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.78□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 COL4A6Q14031 1691 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 VWA8A3KMH1 1905 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 MED13Q9UHV7 2174 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 CELA1Q9UNI1 258 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 RBX1P62877 108 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf99Q4VX62 202 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.77□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 E7EUB6 86 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 PRR31Q5SQ13 230 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 U3KQA8 63 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB135Q30KP9 77 aa4.76□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 NUPR1O60356 82 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 MED12LQ86YW9 2145 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 LY6LH3BQJ8 138 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZQY7 126 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf48Q96LS8 159 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 COL4A5P29400 1685 aa4.75□□□□□ -1.65
SCN2A-209ENST00000636071 HIVEP2P31629 2446 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms