RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM141Q96I45 108 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C19orf84I3L1E1 186 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01620Q4KN68 170 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 NRACQ8N912 160 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 USMG5Q96IX5 58 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 CRPP02741 224 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TOMM6Q96B49 74 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 HIGD1BQ9P298 99 aa9.32□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 B4DSR2 109 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 U3KQE9 123 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PPR1 153 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TM2D2Q9BX73 214 aa9.31□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 ITPR3Q14573 2671 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0J9YY99 117 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 F8W735 103 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB4AO15263 64 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TAL2Q16559 108 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP5G1P05496 136 aa9.3□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA7O95182 113 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 GATA3P23771 443 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 PCSK5Q92824 1860 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A087WW49 117 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 XCL1P47992 114 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.29□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 PF4P02776 101 aa9.28□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.28□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 LY6LH3BQJ8 138 aa9.27□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.27□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.27□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 MALP21145 153 aa9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 NFE4Q86UQ8 179 aa9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 SIRPDQ9H106 197 aa9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHG4P01861 327 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 RHODO00212 210 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 LMO4P61968 165 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.26□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 CRLF1O75462 422 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 NOTCH1P46531 2555 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 LEPROTO15243 131 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 U3KQK5 164 aa9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIAP1O43715 76 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 PEMTQ9UBM1 199 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 INSP01308 110 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 Q9UF83 564 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0J9YXY3 114 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 SLPIP03973 132 aa9.24□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 ODF3BA8MYP8 253 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC179H3BU77 68 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 HERV-K104P63124 156 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 HAMPP81172 84 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 CFAP161Q6P656 301 aa9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.22□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 NF1P21359 2839 aa9.22□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.22□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.21□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 LGALS9O00182 355 aa9.21□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.21□□□□□ -0.93
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.21□□□□□ -0.94
TRIOBP-211ENST00000492485 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.21□□□□□ -0.94
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