RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 PCP2Q8IVA1 136 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 MRAP2Q96G30 205 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 INSP01308 110 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP10-3P60369 221 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 DEFB4AO15263 64 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 K7EMI3 77 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 CCL25O15444 150 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE1Q13065 139 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 DEFB130BP0DP73 79 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 DEFB130AP0DP74 79 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01545Q5VT33 79 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE12BA1L429 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE7O76087 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 CRYGDP07320 174 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE12FP0CL80 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE12GP0CL81 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE12IP0CL82 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 ATP5LO75964 103 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 IGKCP01834 107 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF415Q09FC8 603 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 VCYO14598 125 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZSN1 163 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZTI0 123 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 RRN3P1Q2M238 152 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 RAB37Q96AX2 223 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00315P59091 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 DPM2O94777 84 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ODF1Q14990 250 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 M0R2P5 195 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 C9orf85Q96MD7 179 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 M0QY20 66 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 FHL3Q13643 280 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF479Q96JC4 524 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRK-216ENST00000524481 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 C20orf78Q9BR46 151 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE12JA6NER3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 GCSHP23434 173 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE4Q13068 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE5Q13069 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 GAGE13Q4V321 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 A0A096LPF7 62 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2V1Q13404 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 C16orf95Q9H693 158 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 ODF3Q96PU9 254 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 K7EP13 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 PPP1R17O96001 155 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 IGLV1-51P01701 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 MED14OSP0DP75 135 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 HTN3P15516 51 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 RBX1P62877 108 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 BAALCQ8WXS3 180 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 CRLF1O75462 422 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 COX11Q9Y6N1 276 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-216ENST00000524481 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 A8MWV9 139 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 H7C1H1 209 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 COX8AP10176 69 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 DEFB135Q30KP9 77 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 A0A087WX48 190 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 I3L3M4 83 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-216ENST00000524481 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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