RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	PMCH	P20382	165 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	PKIA	P61925	76 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	CUBN	O60494	3623 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	CENPE	Q02224	2701 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	CHD6	Q8TD26	2715 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262		A8MTW9	85 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	KLLN	B2CW77	178 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01619	G3V211	115 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262		H0Y8G0	127 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	HSBP1	O75506	76 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC00614	P0C842	121 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	C3orf79	P0CE67	100 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	NTF3	P20783	257 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	CACNG7	P62955	275 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A0J9YX75	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		F6UB75	175 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	TSTD3	H0UI37	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		M0R2Z0	102 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	PPBP	P02775	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	DSCR10	P59022	87 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB1	P60022	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		Q6ZQT7	251 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	PRELID3A	Q96N28	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A096LNJ9	63 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		D6R8Y8	96 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	CTAG1A	P78358	180 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	TDRG1	Q3Y452	100 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	OR11H1	Q8NG94	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	C7orf71	A4D174	169 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		H3BVH4	76 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	TCF21	O43680	179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	LEPROTL1	O95214	131 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	NPY	P01303	97 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	DDT	P30046	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	CKS2	P33552	79 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	ASIP	P42127	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	KRTDAP	P60985	99 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	PMCHL1	Q16048	86 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262		Q6ZR54	194 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	PRO1933	Q9H354	126 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ZNF638-223	ENST00000492262	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81

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