RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRORY	Q9H606	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038		U3KQE9	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-217	ENST00000521038	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A087WW49	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	PF4	P02776	101 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ELANE	P08246	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLA2G5	P39877	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q9UFV3	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		I3L2K1	104 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		K7ENP7	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	VCY	O14598	125 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFC1	O43677	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		H7C423	109 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCL5	P13501	91 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00205	P59089	165 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	NPC2	P61916	151 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q6JHZ5	121 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q6ZQT7	251 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TCF15	Q12870	199 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	COX7A2L	O14548	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFB3	O43676	98 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIAP1	O43715	76 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIA	Q16674	131 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
PHF20L1-217	ENST00000521038	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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