RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 OR51M1Q9H341 326 aa12.5□□□□□ -0.41
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HOXD12-201ENST00000404162 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.49□□□□□ -0.41
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HOXD12-201ENST00000404162 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.49□□□□□ -0.41
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HOXD12-201ENST00000404162 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.43□□□□□ -0.42
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HOXD12-201ENST00000404162 INPP1P49441 399 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD12-201ENST00000404162 TMED6Q8WW62 240 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD12-201ENST00000404162 TVP23CQ96ET8 276 aa12.42□□□□□ -0.42
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HOXD12-201ENST00000404162 Q9UF83 564 aa12.42□□□□□ -0.42
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HOXD12-201ENST00000404162 UBE2WQ96B02 151 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD12-201ENST00000404162 KCNS1Q96KK3 526 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD12-201ENST00000404162 SH3BGRL3Q9H299 93 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD12-201ENST00000404162 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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HOXD12-201ENST00000404162 HBG2P69892 147 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 HYLS1Q96M11 299 aa12.39□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PANO1I0J062 215 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ODF1Q14990 250 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 STX12Q86Y82 276 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 THAP6Q8TBB0 222 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf50Q96LR7 162 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WWC5 75 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 H3BMQ9 156 aa12.37□□□□□ -0.43
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HOXD12-201ENST00000404162 C14orf177Q52M58 125 aa12.37□□□□□ -0.43
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HOXD12-201ENST00000404162 C9orf85Q96MD7 179 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TREM1Q9NP99 234 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 S100A10P60903 97 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PGPA6NDG6 321 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 SEC11BP0C7V7 166 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PTH2Q96A98 100 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 PARLQ9H300 379 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NHLH2Q02577 135 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 RAB32Q13637 225 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 NMES1Q9C002 83 aa12.34□□□□□ -0.43
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
HOXD12-201ENST00000404162 IL15RAQ13261 267 aa12.33□□□□□ -0.44
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.33□□□□□ -0.44
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