RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 RPL29P47914 159 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 NHLH2Q02577 135 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 ATP6V1FQ16864 119 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 C10orf113Q5VZT2 155 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 CHAC2Q8WUX2 184 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 FGF7P21781 194 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 CYCSP99999 105 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.78□□□□□ -0.36
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CS-219ENST00000550655 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-219ENST00000550655 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.78□□□□□ -0.36
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CS-219ENST00000550655 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 B2MP61769 119 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 Q6ZRG5 221 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.77□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 OR5C1Q8NGR4 320 aa12.77□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 CELA1Q9UNI1 258 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 PXMP4Q9Y6I8 212 aa12.77□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 OR1L4Q8NGR5 311 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 PFDN5Q99471 154 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 RNF126Q9BV68 326 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 TRAV5A0A0B4J249 113 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 SLC17A3O00476 420 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 MPDU1O75352 247 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 SLC50A1Q9BRV3 221 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 H3BQ15 152 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 H3BTX0 84 aa12.74□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 PTTG1O95997 202 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 CLINT1Q14677 625 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 Q6ZTC4 211 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 THAP6Q8TBB0 222 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 ALG5Q9Y673 324 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 M0R2Z0 102 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 CRXO43186 299 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.73□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.72□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 RFNGQ9Y644 331 aa12.72□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 C12orf74Q32Q52 190 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 BAP18Q8IXM2 172 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.71□□□□□ -0.37
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CS-219ENST00000550655 MBD2Q9UBB5 411 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 HSPB11Q9Y547 144 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-219ENST00000550655 TMEM189A5PLL7 270 aa12.7□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 INSP01308 110 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 GUK1Q16774 197 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 ATP5SQ99766 215 aa12.7□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.69□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 HBE1P02100 147 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.68□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 PYYP10082 97 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 RHOBP62745 196 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.68□□□□□ -0.38
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CS-219ENST00000550655 KCNIP2Q9NS61 270 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 NDUFB4O95168 129 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 RRN3P1Q2M238 152 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-219ENST00000550655 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.67□□□□□ -0.38
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