RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 A0A087X0K7 114 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 A8MTW9 85 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 H0YIZ8 118 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 CXCL3P19876 107 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PRR20EP86478 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PRR20CP86479 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PRR20DP86480 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PRR20BP86481 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PRR20AP86496 221 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.75□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 HRH4Q9H3N8 390 aa8.75□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 APLNQ9ULZ1 77 aa8.75□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 FGF7P21781 194 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 SULT1A1P50225 295 aa8.74□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 H3BQ15 152 aa8.73□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 VWC2Q2TAL6 325 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.73□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 NEU1Q99519 415 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 DNAH2Q9P225 4427 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 HBE1P02100 147 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 S100A7P31151 101 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 H2BFSP57053 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 B2MP61769 119 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 RHOBP62745 196 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 CLINT1Q14677 625 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 STX12Q86Y82 276 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-246ENST00000496569 RFNGQ9Y644 331 aa8.72□□□□□ -1.01
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HDLBP-246ENST00000496569 S100A11P31949 105 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 LCN15Q6UWW0 184 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.71□□□□□ -1.02
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HDLBP-246ENST00000496569 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.71□□□□□ -1.02
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HDLBP-246ENST00000496569 J3KRW8 73 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 PRAF2O60831 178 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 INSP01308 110 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 AZU1P20160 251 aa8.7□□□□□ -1.02
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HDLBP-246ENST00000496569 HBG2P69892 147 aa8.7□□□□□ -1.02
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HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZRG5 221 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.7□□□□□ -1.02
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HDLBP-246ENST00000496569 NMES1Q9C002 83 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 E5RGE8 158 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 M0R3E3 92 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SSNA1O43805 119 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 FCN2Q15485 313 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 S100A7AQ86SG5 101 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 RNF126Q9BV68 326 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.69□□□□□ -1.02
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