RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477965.1

RBMS1-212, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-212ENST00000477965 YEATS4O95619 227 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PANX2Q96RD6 677 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 USP28Q96RU2 1077 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 JCADQ9P266 1359 aa7.31□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 A0A1B0GUA9 196 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 KIAA0754O94854 1291 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CCT5P48643 541 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FNTAP49354 379 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 IRAK1P51617 712 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 VSNL1P62760 191 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FLIIQ13045 1269 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 DRP2Q13474 957 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 DCTN1Q14203 1278 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PPP2R5AQ15172 486 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 G2E3Q7L622 706 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 C14orf37Q86TY3 774 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SGSM3Q96HU1 749 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SLAIN2Q9P270 581 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NUTM2FA1L443 756 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ZEB2O60315 1214 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PFKFB2O60825 505 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SMTNP53814 917 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ICA1Q05084 483 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 OLFM4Q6UX06 510 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 RNF217Q8TC41 542 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 RUBCNQ92622 972 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 USP44Q9H0E7 712 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.3□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ALDH1L1O75891 902 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CMA1P23946 247 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 STIM1Q13586 685 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TC2NQ8N9U0 490 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 COG1Q8WTW3 980 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 JAK2O60674 1132 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PHACTR2O75167 634 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 ZNF202O95125 648 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SCP2P22307 547 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NDUFA8P51970 172 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 FAM212AQ96EL1 285 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CCDC51Q96ER9 411 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NEK1Q96PY6 1258 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 CABP1Q9NZU7 370 aa7.29□□□□□ -1.24
RBMS1-212ENST00000477965 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 218.8 ms