RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 MECOMQ03112 1051 aa25.32■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.32■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.32■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.32■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.32■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.31■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 NUCB1Q02818 461 aa25.31■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CAPNS2Q96L46 248 aa25.31■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 LDHCP07864 332 aa25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 ZAP70P43403 619 aa25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 DOCK2Q92608 1830 aa25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CACNB3P54284 484 aa25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 FAM83AQ86UY5 434 aa25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 LNPKQ9C0E8 428 aa25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.29■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 GRM1Q13255 1194 aa25.28■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.28■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 RGMBQ6NW40 437 aa25.28■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.28■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 BTDP43251 543 aa25.27■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 USP40Q9NVE5 1235 aa25.27■■□□□ 1.64
C4orf48-201ENST00000409248 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 HOOK2Q96ED9 719 aa25.26■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 GPATCH3Q96I76 525 aa25.26■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.26■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.25■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF384Q8TF68 577 aa25.25■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC102AQ96A19 550 aa25.25■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 TEPSINQ96N21 525 aa25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 ATP5JP18859 108 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K12Q12852 859 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 NOGQ13253 232 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 PRKG1Q13976 671 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MOB2Q70IA6 237 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 FAM151AQ8WW52 585 aa25.23■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MAP2K2P36507 400 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K11Q16584 847 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 IDI2Q9BXS1 227 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 OTOFQ9HC10 1997 aa25.22■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 BAG3O95817 575 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 SLC10A3P09131 477 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 PLCG2P16885 1265 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 MX1P20591 662 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 NFIAQ12857 509 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 AK9Q5TCS8 1911 aa25.21■■□□□ 1.63
C4orf48-201ENST00000409248 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 UNCXA6NJT0 531 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ENTPD3O75355 529 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 TCP10Q12799 353 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.2■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 GOLIM4O00461 696 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 RGS3P49796 1198 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF15Q66K64 600 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 CERS3Q8IU89 383 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 HAUS7Q99871 368 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.19■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 AOC2O75106 756 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 CYP7A1P22680 504 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 RHBDL3P58872 404 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.18■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 FOCADQ5VW36 1801 aa25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 ERC2O15083 957 aa25.17■■□□□ 1.62
C4orf48-201ENST00000409248 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms