RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 C6orf223Q8N319 242 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM127O75204 238 aa11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-215ENST00000510074 IGKV1-5P01602 117 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 IL4P05112 153 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 OR10J1P30954 320 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 ID1P41134 155 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-215ENST00000510074 RRN3P1Q2M238 152 aa11.21□□□□□ -0.61
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SH3BP2-215ENST00000510074 IGLC1P0CG04 106 aa11.2□□□□□ -0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.18□□□□□ -0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.17□□□□□ -0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 NPIPB3Q92617 1050 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 TP53RKQ96S44 253 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 F5H768 121 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 TOMM40O96008 361 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 RORCP51449 518 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-215ENST00000510074 RND3P61587 244 aa11.16□□□□□ -0.62
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SH3BP2-215ENST00000510074 FAM78BQ5VT40 261 aa11.16□□□□□ -0.62
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