RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CD37P11049 281 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FUT6P51993 359 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R45P59539 299 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DAD1P61803 113 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 UBA52P62987 128 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 HBA1P69905 142 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 INCA1Q0VD86 236 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PMCHL1Q16048 86 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf58Q2M2W7 97 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MPV17L2Q567V2 206 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PAGE3Q5JUK9 113 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GLYATL3Q5SZD4 288 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TEX36Q5VZQ5 186 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SPSB3Q6PJ21 355 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf66Q6UXQ4 117 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD6Q7Z4G1 85 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR13A1Q8NGR1 328 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SSC4DQ8WTU2 575 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DDB2Q92466 427 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C18orf12Q96KH6 178 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PRELID3AQ96N28 172 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR2V2Q96R30 315 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PEBP4Q96S96 227 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CHAC1Q9BUX1 264 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PPDPFQ9H3Y8 114 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 INSL5Q9Y5Q6 135 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 WSB1Q9Y6I7 421 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FTCDNL1E5RQL4 147 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC17A2O00624 439 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PEX7O00628 323 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FUT3P21217 361 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR3A4PP47883 348 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DLX1P56177 255 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 WNT4P56705 351 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FAM53BQ14153 422 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 Q56UQ5 140 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 WDR82Q6UXN9 313 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHA9Q7RTU4 235 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ODF3L1Q8IXM7 274 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DEFB108BQ8NET1 73 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR8B3Q8NGG8 313 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NT5CQ8TCD5 201 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3IP1Q96FE7 263 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR8B2Q96RD0 313 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFB11Q9NX14 153 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TNFSF18Q9UNG2 199 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC88CQ9P219 2028 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ACACBO00763 2458 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 USF3Q68DE3 2245 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SMCHD1A6NHR9 2005 aa1.99□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV27A0A087WT01 109 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 IDSB3KWA1 339 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM238C9JI98 176 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01565O15544 149 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CD1DP15813 335 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC6A1P30531 599 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MPV17P39210 176 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 GGTLC2Q14390 218 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 CDK5R1Q15078 307 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 DEFB133Q30KQ1 61 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PYCR3Q53H96 274 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 LYZL2Q7Z4W2 148 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM144Q7Z5S9 345 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 WFDC11Q8NEX6 87 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 OR4C3Q8NH37 302 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM158Q8WZ71 300 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SPTSSAQ969W0 71 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS27Q9BQR3 290 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 APOOQ9BUR5 198 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A2Q9BXI2 301 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SPHK2Q9NRA0 654 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 V9GY05 133 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM189A5PLL7 270 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 H3BQ15 152 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 J3QLI3 93 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 FCN1O00602 326 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 VENTXO95231 258 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A10O95528 541 aa1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CCSAP-202ENST00000366686 PTHLHP12272 177 aa1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms