RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 APCP25054 2843 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD17A6NE02 478 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 REG1AP05451 166 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FBP1P09467 338 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CTRB1P17538 263 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB31Q13636 194 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CTRB2Q6GPI1 263 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1L6Q8NGR2 347 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPC1AQ92747 370 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 VSIRQ9H7M9 311 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA12Q86UK0 2595 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPEQ02224 2701 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN15O95858 294 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1C1Q04828 323 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FFAR4Q5NUL3 377 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SPSB3Q6PJ21 355 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 LFNGQ8NES3 379 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35E1Q96K37 410 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RASL11BQ9BPW5 248 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NPIPB5A8MRT5 1133 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 AGPAT2O15120 278 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 HBE1P02100 147 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL29P47914 159 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MLANAQ16655 118 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ELLP55199 621 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB2AP61019 212 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NDPQ00604 133 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF726P1Q15940 193 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ASPHD1Q5U4P2 390 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf139Q6ZV77 190 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC9CQ8N5M4 171 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 C5orf56Q8N8D9 126 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 THAP8Q8NA92 274 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SSX3Q99909 188 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC45A2Q9UMX9 530 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MOB4Q9Y3A3 225 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 A6NDX4 124 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 M6PRP20645 277 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR20EP86478 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR20CP86479 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR20DP86480 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR20BP86481 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR20AP86496 221 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2T6Q8NHC8 308 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT10AQ9GZT5 417 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NAV3Q8IVL0 2385 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 I3L521 148 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 YIF1AO95070 293 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WFDC11Q8NEX6 87 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10G4Q8NGN3 311 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10G9Q8NGN4 311 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10G7Q8NGN6 311 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SCRT1Q9BWW7 348 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00869P0C866 280 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 APELAP0DMC3 54 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK9Q2XQG4 91 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TOR2AQ5JU69 321 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SFT2D1Q8WV19 159 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MISP3Q96FF7 219 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK9Q9UKQ9 250 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 KRBOX1C9JBD0 128 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 I3L2K1 104 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB5BO43169 146 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CD5P06127 495 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PMS2P11Q13670 270 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MIC13Q5XKP0 118 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 C19orf35Q6ZS72 473 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf82Q7Z2V1 217 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM116Q8NCL8 245 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SGMS2Q8NHU3 365 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NANPQ8TBE9 248 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM68Q96MH6 324 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM210AQ96ND0 272 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPB9Q9BQS6 159 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A9Q9NUM3 307 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CYSRT1A8MQ03 144 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 AMY1AP04745 511 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZP3P21754 424 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10J1P30954 320 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms