RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 VAX2Q9UIW0 290 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PAX6P26367 422 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PN81 502 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A6NNC1 897 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 E7EUB6 86 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 H3BQ15 152 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 YIF1AO95070 293 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CHRNA7P36544 502 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TUBA4BQ9H853 241 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MANBALQ9NQG1 85 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CGB1A6NKQ9 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LY6LH3BQJ8 138 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A17O43808 307 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 DEFA4P12838 97 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CDKN1AP38936 164 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CEBPGP53567 150 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MIC13Q5XKP0 118 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TEX45Q8NA69 505 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RITA1Q96K30 269 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 COLCA2A8K830 154 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 M0R1W7 72 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 COX7A1P24310 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 AKR1C3P42330 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PSMB3P49720 205 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CD81P60033 236 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 B2MP61769 119 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RAB31Q13636 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PNKDQ8N490 385 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPV4 95 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CRYGBP07316 175 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRR20EP86478 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRR20CP86479 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRR20DP86480 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRR20BP86481 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRR20AP86496 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 WT1-ASQ06250 92 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CD69Q07108 199 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MOB3BQ86TA1 216 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 STPG3Q8N7X2 389 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RPEQ96AT9 228 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TVP23CQ96ET8 276 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPI3 338 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM250H0YL14 139 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 STAG3L2P0CL84 134 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 STAG3L3P0CL85 134 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ARF6P62330 175 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 GAMTQ14353 236 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MMD2Q8IY49 270 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RNF5Q99942 180 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WWC5 75 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFS7O75251 213 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-208ENST00000502484 GOSR1O95249 250 aa6.58□□□□□ -1.36
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