RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 RHOBP62745 196 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SLAQ13239 276 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 EFNB3Q15768 340 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MUC15Q8N387 334 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR4A16Q8NH70 328 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 NUDT11Q96G61 164 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TMEM11P17152 192 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 UBE2G1P62253 170 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 H0Y8G0 127 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 M0R296 226 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MPDU1O75352 247 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CA7P43166 264 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CAMPP49913 170 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 RIPPLY3P57055 190 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ARG2P78540 354 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TTC28Q96AY4 2481 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 C5orf30Q96GV9 206 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CSTL1Q9H114 145 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 C9JCJ5 164 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 GRPP07492 148 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 LINC00869P0C866 280 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MFAP2P55001 183 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 AESQ08117 197 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ZNF766Q5HY98 468 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 PSG11Q9UQ72 335 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CACNA1HO95180 2353 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 LINC00473A8K010 186 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 K7ERU9 68 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR7C2O60412 319 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 FCGR3BO75015 233 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TOX4O94842 621 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR9G9P0C7N8 305 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR8B2Q96RD0 313 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 HINT2Q9BX68 163 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 C12orf77C9JDV5 145 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SMPD2O60906 423 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 P0C879 139 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 IGHV1-2P23083 117 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MUC21Q5SSG8 566 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 STPG3Q8N7X2 389 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 NEUROG1Q92886 237 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MGAQ8IWI9 3026 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 J3QT63 122 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-13P01766 116 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-7P01780 117 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 HBZP02008 142 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR10J4P0C629 311 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 CD46P15529 392 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 IL19Q9UHD0 177 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 GAGE12BA1L429 117 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 M0R1X1 148 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 WNT9BO14905 357 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 AGFG2O95081 481 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 NPY1RP25929 384 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MPV17P39210 176 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 COX19Q49B96 90 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TAAR6Q96RI8 345 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 hDV102S1A0JD36 115 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 OR4C46A6NHA9 309 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TAX1BP3O14907 124 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 RAB31Q13636 194 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 FZR1Q9UM11 496 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 REG1AP05451 166 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 SSTR5P35346 364 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-212ENST00000488380 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms