RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 DKK1O94907 266 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 MFAP4P55083 255 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 RPRMQ9NS64 109 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 PGPA6NDG6 321 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 PROB1E7EW31 1015 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 FOXF2Q12947 444 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 GFI1Q99684 422 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 TM4SF5O14894 197 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 LEPROTL1O95214 131 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 C8orf88P0DMB2 117 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 JMJD8Q96S16 334 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.59□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 CD5P06127 495 aa14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 PDLIM4P50479 330 aa14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GAREM2-202ENST00000407684 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 M0R3E3 92 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 WISP1O95388 367 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 CELA3BP08861 270 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 SRIP30626 198 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 METTL26Q96S19 204 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.58□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 FOXH1O75593 365 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TWIST1Q15672 202 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PNKDQ8N490 385 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 LYZL4Q96KX0 146 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM189A5PLL7 270 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 SCGB1A1P11684 91 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 SPSB4Q96A44 273 aa14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 LY6DQ14210 128 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 C1QL4Q86Z23 238 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 EGR1P18146 543 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 CRYBB3P26998 211 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 COPS9Q8WXC6 57 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NABP2Q9BQ15 211 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TM4SF20Q53R12 229 aa14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 BSPH1Q075Z2 132 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 BIVMQ86UB2 503 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 REG1AP05451 166 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 COX6CP09669 75 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 CKS2P33552 79 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 ATOH7Q8N100 152 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.55□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 IGHV2-5P01817 119 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 AMY1AP04745 511 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 FABP2P12104 132 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 C17orf98A8MV24 154 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM250H0YL14 139 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 TMEM177Q53S58 311 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 RNF126Q9BV68 326 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 PLP1P60201 277 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.54□□□□□ -0.08
GAREM2-202ENST00000407684 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms