RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PEX2P28328 305 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARF6P62330 175 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL10RBQ08334 325 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADIGQ0VDE8 80 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDCLQ13371 301 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 QPRTQ15274 297 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR1C1Q15619 314 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBE2V2Q15819 145 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q6JHZ5 121 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PNCKQ6P2M8 343 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYP20A1Q6UW02 462 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEPT14Q6ZU15 432 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRSN1Q8IZ57 195 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FADS6Q8N9I5 356 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FNDC5Q8NAU1 212 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STKLD1Q8NE28 680 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf40Q8WZ69 217 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPDL1Q96EA4 605 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YPEL4Q96NS1 127 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM111AQ96PZ2 611 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKRD19PQ9H560 264 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOMER3Q9NSC5 361 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GINM1Q9NU53 330 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL19Q9UHD0 177 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANAPC10Q9UM13 185 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM50BQ9Y247 325 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCN11AQ9UI33 1791 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CUX2O14529 1486 aa-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKNAQ7Z591 1439 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HEATR9A2RTY3 570 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 M0R036 132 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SH2D1BO14796 132 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR7A10O76100 309 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HLA-DRB1P01911 266 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR4Q2P0C623 313 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SULT1A3P0DMM9 295 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SULT1A4P0DMN0 295 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PFN2P35080 140 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GNALP38405 381 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACADSBP45954 432 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SULT1A1P50225 295 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FXYD7P58549 80 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPP38P78345 283 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ICA1Q05084 483 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALNTL6Q49A17 601 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MESTQ5EB52 335 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GSTA5Q7RTV2 222 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM251Q8N6I4 163 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR56B2PQ8NGI1 322 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIT1Q92963 219 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MCUR1Q96AQ8 359 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERP27Q96DN0 273 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBXN10Q96LJ8 280 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TCHPQ9BT92 498 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AP1M1Q9BXS5 423 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDH20Q9HBT6 801 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GDE1Q9NZC3 331 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAT8BQ9UHF3 227 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POMPQ9Y244 141 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUDCQ9Y266 331 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TIMM22Q9Y584 194 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NCOA2Q15596 1464 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1B0GUL6 1792 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A096LPI6 279 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A6NCN8 305 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR2A4O95047 310 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YEATS4O95619 227 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CST1P01037 141 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL12AP29459 219 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADORA1P30542 326 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.6 ms