RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 GNG4P50150 75 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PTPRDP23468 1912 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HBZP02008 142 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 MT-ND6P03923 174 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SOD3P08294 240 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CXCL1P09341 107 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CD99P14209 185 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LINC00596Q86U02 117 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RBKSQ9H477 322 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR2J3O76001 311 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CELA3AP09093 270 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SCTP09683 121 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM122AQ96E09 287 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SNURFLB1AK76 121 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 C9JQL5 133 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RAB29O14966 203 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR2H2O95918 312 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LEMD1Q68G75 181 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LRTM2Q8N967 370 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PARLQ9H300 379 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IL19Q9UHD0 177 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FHL1Q13642 323 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PSG5Q15238 335 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR4C12Q96R67 309 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 WFDC1Q9HC57 220 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 J3QR89 54 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HPRT1P00492 218 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CEACAM1P13688 526 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 GPR146Q96CH1 333 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF714Q96N38 554 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 DIRC2Q96SL1 478 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IER3P46695 156 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CAMPP49913 170 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CCL20P78556 96 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PDPNQ86YL7 162 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 C18orf12Q96KH6 178 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 F5H697 171 aa8.52□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 K7ERU9 68 aa8.52□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ECSCRQ19T08 205 aa8.52□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.52□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 ODAMA1E959 279 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 AMBPP02760 352 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 FA2HQ7L5A8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 EFEMP2O95967 443 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 ERVFRD-1P60508 538 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 GPHA2Q96T91 129 aa8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 CXorf1O96002 111 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 FAM87AP0C7U9 286 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 PMCHL1Q16048 86 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 SPATA45Q537H7 98 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 OR1L1Q8NH94 360 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-209ENST00000446688 VWA8A3KMH1 1905 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms