RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	UBE2E1	P51965	193 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TXNL1	O43396	289 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00205	P59089	165 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	DDB2	Q92466	427 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LHX4	Q969G2	390 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RPE	Q96AT9	228 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CENPE	Q02224	2701 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		J3QLI3	93 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31	3e-6	■■■■□ 23.4
RNPS1-223	ENST00000568631	TGFA	P01135	160 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IFNA21	P01568	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LGALS4	P56470	323 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RAMP3	O60896	148 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	FCGR3B	O75015	233 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ADAP1	O75689	374 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	HOXB5	P09067	269 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	EPHA1	P21709	976 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LPAR6	P43657	344 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	REG1B	P48304	166 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CD83	Q01151	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ATG12	O94817	140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	APOA2	P02652	100 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RRAS	P10301	218 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1W2PRD5	423 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1W2PRF3	423 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1W2PRM7	423 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CCS	O14618	274 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	HPRT1	P00492	218 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	VDAC1	P21796	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	H2BFS	P57053	126 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MIDN	Q504T8	468 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631		H0YJW9	148 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	SIX6	O95475	246 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	MC5R	P33032	325 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	NPFF	O15130	113 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	OR2A4	O95047	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	S1PR2	O95136	353 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB13	P51153	203 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNPS1-223	ENST00000568631	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms