RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 Q9H521 79 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 I3L521 148 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 SLC6A1P30531 599 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 MC5RP33032 325 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 SDC2P34741 201 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ZNF580Q9UK33 172 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 OR5H8P0DN80 308 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 PTHLHP12272 177 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 SLURP1P55000 103 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 FHL3Q13643 280 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.23□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 BVESQ8NE79 360 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.23□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 LINC00473A8K010 186 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 RBBP9O75884 186 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 APOA2P02652 100 aa8.22□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 CD36P16671 472 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 TALDO1P37837 337 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 FXYD3Q14802 87 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 IDNKQ5T6J7 187 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 TPRA1Q86W33 373 aa8.22□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 DPF1Q92782 380 aa8.22□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 VSIG4Q9Y279 399 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 ECI1P42126 302 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 RANBP1P43487 201 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 SERPINB10P48595 397 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 DGCR2P98153 550 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 ZNF616Q08AN1 781 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 ACTBL2Q562R1 376 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 HACD4Q5VWC8 232 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-213ENST00000494956 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.21□□□□□ -1.1
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