RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557496.1

FOXN3-216, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 228 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-216ENST00000557496 ERHP84090 104 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FAM3AP98173 230 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZNF90Q03938 601 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PLCXD2Q0VAA5 305 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NNATQ16517 81 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 C4orf26Q17RF5 130 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CENPWQ5EE01 88 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HBMQ6B0K9 141 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR10K2Q6IF99 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FAM173BQ6P4H8 233 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 AHSA2Q719I0 299 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OTUD6AQ7L8S5 288 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 BLIDQ8IZY5 108 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 Q8N6K4 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DAND5Q8N907 189 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 BBOF1Q8ND07 529 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR52K2Q8NGK3 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR1L8Q8NGR8 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR6N2Q8NGY6 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR11H2Q8NH07 326 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CLDND2Q8NHS1 167 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FNDC9Q8TBE3 224 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FAM45AQ8TCE6 357 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LGALS14Q8TCE9 139 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DOK4Q8TEW6 326 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TAMM41Q96BW9 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GALMQ96C23 342 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MRAP2Q96G30 205 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SFRP2Q96HF1 295 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PITX2Q99697 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SMR3AQ99954 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FAAP24Q9BTP7 215 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HAUS4Q9H6D7 363 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TMBIM4Q9HC24 238 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NDUFB11Q9NX14 153 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SNX12Q9UMY4 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HHLA3Q9XRX5 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SETD5Q9C0A6 1442 aa-0.05□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ABCB11O95342 1321 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LINC00862A6NCI5 91 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 EFCAB9A8MZ26 197 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 H3BSA7 217 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 H3BT86 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 I3L4J1 428 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 M0R381 172 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PSMD11O00231 422 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MRASO14807 208 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SGCEO43556 437 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CST4P01036 141 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CRPP02741 224 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ATP5G1P05496 136 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SLC35E2BP0CK96 405 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LIMS3P0CW19 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LIMS4P0CW20 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RD3LP0DJH9 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GIMD1P0DJR0 217 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CCL2P13500 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CXCL2P19875 107 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CXCL3P19876 107 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PTNP21246 168 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 F8A1P23610 371 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GADD45AP24522 165 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ADORA1P30542 326 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GRPRP30550 384 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR10J1P30954 320 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OPRM1P35372 400 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DEKP35659 375 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IFNGR2P38484 337 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RANBP1P43487 201 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR1E2P47887 323 aa-0.06□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HSPA13P48723 471 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms