RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000159111.8

KDM4B-201, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4B, Length 5,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-201ENST00000159111 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 RUNX1Q01196 453 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 MMD2Q8IY49 270 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 FGFRL1Q8N441 504 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 AICDAQ9GZX7 198 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 TMEM187Q14656 261 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 ECSCRQ19T08 205 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 WNT5AP41221 380 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 CRYBA2P53672 197 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.65□□□□□ -0.06
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KDM4B-201ENST00000159111 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-201ENST00000159111 FADS6Q8N9I5 356 aa14.65□□□□□ -0.06
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KDM4B-201ENST00000159111 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CDK2AP1O14519 115 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 FAM106CPP0CH98 169 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 19.2
KDM4B-201ENST00000159111 RAB24Q969Q5 203 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 OR10J1P30954 320 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TIMP4Q99727 224 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TM2D1Q9BX74 207 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.63□□□□□ -0.07
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KDM4B-201ENST00000159111 Q6ZT83 130 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SNURFLB1AK76 121 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ADAM11O75078 769 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 IER3P46695 156 aa14.63□□□□□ -0.07
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KDM4B-201ENST00000159111 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SMIM8Q96KF7 97 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TNFRSF9Q07011 255 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 HIST3H3Q16695 136 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 PRO1933Q9H354 126 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TMEM140Q9NV12 185 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 IL17BQ9UHF5 180 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 M0R143 59 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 POC1AQ8NBT0 407 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 MIOXQ9UGB7 285 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SYNGR3O43761 229 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 APELAP0DMC3 54 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 H2BFSP57053 126 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 PAFAH1B2P68402 229 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 BET1LQ9NYM9 111 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 OR2A4O95047 310 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CD8AP01732 235 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 PRSS1P07477 247 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 TGIF1Q15583 401 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 RHOVQ96L33 236 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 OR2A7Q96R45 310 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CSN3P07498 182 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 LTBRP36941 435 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 HERVK_113P61574 105 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 PET117Q6UWS5 81 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CLDN18P56856 261 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 CSRP2Q16527 193 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNHIT1O43257 154 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF735P0CB33 412 aa14.6□□□□□ -0.07
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