RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479511.1

GAPVD1-217, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 3

Gene GAPVD1, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-217	ENST00000479511	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	HBEGF	Q99075	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511		A0A0A6YYH2	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511		A6NJ64	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	FGF16	O43320	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	C8G	P07360	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IDO1	P14902	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PSMB5	P28074	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	RAP1A	P62834	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	VCX	Q9H320	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ATM	Q13315	3056 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511		A0A0U1RQV1	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511		C9J4A7	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CCL22	O00626	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	FABP7	O15540	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PSMG1	O95456	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	RAB36	O95755	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ORM1	P02763	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ELK1	P19419	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	NUDT2	P50583	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	IHH	Q14623	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAPVD1-217	ENST00000479511	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	OR1I1	O60431	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	STK16	O75716	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	PSKH1	P11801	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	ME2	P23368	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	SPINT3	P49223	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	PMVK	Q15126	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511		Q6ZSR6	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	MDP1	Q86V88	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAPVD1-217	ENST00000479511	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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