RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	GBF1	Q92538	1859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A0X1KG70	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CD5L	O43866	347 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	SOX14	O95416	240 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TCRB	P04435	133 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RPN2	P04844	631 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	BCHE	P06276	602 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ADRB3	P13945	408 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	UGT2B7	P16662	529 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	HTR1D	P28221	377 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC6A1	P30531	599 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CD52	P31358	61 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	EVI2B	P34910	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TAS2R43	P59537	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	PFN3	P60673	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	HBA1	P69905	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXC5	Q00444	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CDK5	Q00535	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TAL2	Q16559	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TEAD3	Q99594	435 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	AGRN	O00468	2067 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A0B4J2E0	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GW15	77 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378		E7EQ34	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TOR1A	O14656	332 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	PDCD5	O14737	125 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CHP2	O43745	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RP2	O75695	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	SC5D	O75845	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	SOD1	P00441	154 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF17	P17021	662 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ELK1	P19419	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CEL	P19835	753 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TGM4	P49221	684 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CTBP2	P56545	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TAS2R41	P59536	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TAS2R46	P59540	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TSPAN5	P62079	268 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	FABP5	Q01469	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	IRF4	Q15306	451 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL15	Q16663	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBBP4-208	ENST00000463378	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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