RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 P2RY6Q15077 328 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM169BQ8N8A8 192 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF610Q8N9Z0 462 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5C1Q8NGR4 320 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR7Q8TB68 274 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR14J1Q9UGF5 321 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GWJ7 208 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1-39P01597 117 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1D-39P04432 117 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEACAM6P40199 344 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPBWR1P48145 328 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FHITP49789 147 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF718Q3SXZ3 478 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZR03 302 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.9□□□□□ -0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRH1P02810 166 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OMGP23515 440 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP6V0CP27449 155 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DYNLT3P51808 116 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR82Q6UXN9 313 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS33Q8NF86 280 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB40CQ96S21 281 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5H1A6NKK0 313 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UMAD1C9J7I0 102 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WNT9BO14905 357 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QL1O75973 258 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCH1P30793 250 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCF15Q12870 199 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEA15Q15121 130 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GUK1Q16774 197 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF585BQ52M93 769 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BEND4Q6ZU67 534 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KPTNQ9Y664 436 aa13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OOEPA6NGQ2 149 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CST7O76096 145 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NXPH3O95157 252 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHA1P21709 976 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZRM9 215 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DRAM1Q8N682 238 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LFNGQ8NES3 379 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBALD1Q8TB05 177 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNS2Q9ULS6 477 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WSB1Q9Y6I7 421 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GW64 132 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A6NLC8 198 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF212BA8MTL3 300 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNL4K9M1U5 179 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNL1O43396 289 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1-5P01602 117 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FABP6P51161 128 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTP5Q14D33 572 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALMQ96C23 342 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP5SQ99766 215 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.87□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C12orf77C9JDV5 145 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEACAM1P13688 526 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR3A1P47881 315 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MZT1Q08AG7 82 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STX12Q86Y82 276 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COQ2Q96H96 371 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CACNG5Q9UF02 275 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRYQ5TBA9 3013 aa13.86□□□□□ -0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SVILO95425 2214 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.8 ms