RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 HMSDA8MTL9 139 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 SMAGPQ0VAQ4 97 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 CD300LDQ6UXZ3 194 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 WDFY1Q8IWB7 410 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 GPA33Q99795 319 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 IL36RNQ9UBH0 155 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 LIMS2Q7Z4I7 341 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A42Q86VD7 318 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 STXBP6Q8NFX7 210 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 OR10J1P30954 320 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 ARL17AQ8IVW1 177 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 OR4A5Q8NH83 315 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 DDB2Q92466 427 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
ZBED3-201ENST00000255198 A0A1B0GU03 582 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CEACAM18A8MTB9 384 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ASB5Q8WWX0 329 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ABHD14BQ96IU4 210 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 OGG1O15527 345 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 FAM106CPP0CH98 169 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 C10orf35Q96D05 121 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CXCL3P19876 107 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 BGLAPP02818 100 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 DNLZQ5SXM8 178 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 C9orf40Q8IXQ3 194 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ALG14Q96F25 216 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 NEURL2Q9BR09 285 aa17.82■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF343Q6P1L6 599 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 GPR61Q9BZJ8 451 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 OR2V2Q96R30 315 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 DIRC3C9JPN6 131 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CD99P14209 185 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MARVELD1Q9BSK0 173 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 WBP1LQ9NX94 342 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RAG2P55895 527 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MRGPRGQ86SM5 289 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 C7orf77A4D0Y5 90 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 IL11P20809 199 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa17.81■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 DUX5Q96PT3 197 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM218A2RU14 115 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SPINT1O43278 529 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CELA2AP08217 269 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 EFNB2P52799 333 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SIGLEC14Q08ET2 396 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RAXQ9Y2V3 346 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 NUDT3O95989 172 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 PCMT1P22061 227 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 LINC00596Q86U02 117 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 VSIG8P0DPA2 414 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SSTR5P35346 364 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 TTC3P53804 2025 aa17.8■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 B4DEV8 164 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 UPK3AO75631 287 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 COX19Q49B96 90 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MFAP2P55001 183 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 PXMP4Q9Y6I8 212 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 KBTBD11O94819 623 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 NAT2P11245 290 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 HMGA2P52926 109 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SIAH2O43255 324 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 SFTPCP11686 197 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CTDSPLO15194 276 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RAB24Q969Q5 203 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 KLK13Q9UKR3 277 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 FAM74A3Q4VXF1 159 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 OR11H7Q8NGC8 314 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM262E9PQX1 116 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 CKS2P33552 79 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MRAP2Q96G30 205 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 TCF21O43680 179 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R17O96001 155 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 ATP6V0CP27449 155 aa17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 RBM11P57052 281 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
ZBED3-201ENST00000255198 PGLYRP4Q96LB8 373 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms