RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	SEC16A	O15027	2179 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1B0GU03	582 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897		H0YL77	283 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CBR3	O75828	277 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	IL18BP	O95998	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	COX5B	P10606	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	BCL3	P20749	454 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PRSS12	P56730	875 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PLA2G5	P39877	138 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	DYNLT3	P51808	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TAS2R30	P59541	319 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	SRPX	P78539	464 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	LINC00596	Q86U02	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ATP5S	Q99766	215 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	LILRA1	O75019	489 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	IFNA21	P01568	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	NQO2	P16083	231 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CBR1	P16152	277 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	LHX2	P50458	406 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ASCL1	P50553	236 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	RSU1	Q15404	277 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF525	Q8N782	197 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CA14	Q9ULX7	337 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	FAM221A	A4D161	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ADAM20	O43506	726 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	FOSL1	P15407	271 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	VDAC1	P21796	283 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	S100P	P25815	95 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	CLDN18	P56856	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	DLK1	P80370	383 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF766	Q5HY98	468 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	NAT6	Q93015	286 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	FOXB1	Q99853	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CTSC-208	ENST00000533897	SSX3	Q99909	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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