RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	HAS2	Q92819	552 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GLOD5	A6NK44	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	YPEL1	O60688	119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CEACAM4	O75871	244 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	REN	P00797	406 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SFTPD	P35247	375 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RRAD	P55042	308 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FOXK1	P85037	733 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		Q0VFX4	171 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RASD2	Q96D21	266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BOD1	Q96IK1	185 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	YPEL2	Q96QA6	119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR5B12	Q96R08	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CSTL1	Q9H114	145 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		A0A1B0GTH9	108 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		F6UZH7	168 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CCL25	O15444	150 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	AHSA1	O95433	338 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IGHE	P01854	428 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CELA2A	P08217	269 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ESD	P10768	282 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BMP5	P22003	454 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BMI1	P35226	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BTN3A2	P78410	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CCL20	P78556	96 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	UNC119	Q13432	240 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SMIM10	Q96HG1	83 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MS4A10	Q96PG2	267 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TBX15	Q96SF7	602 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LANCL2	Q9NS86	450 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RNF150	Q9ULK6	438 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BSN	Q9UPA5	3926 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SEC16A	O15027	2179 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	COX6A1	P12074	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PLA2G2A	P14555	144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MMP9	P14780	707 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DUSP1	P28562	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ARR3	P36575	388 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PLAUR	Q03405	335 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF92	Q03936	586 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PRSS8	Q16651	343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FHL5	Q5TD97	284 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF738	Q8NE65	137 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TNFRSF14	Q92956	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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