RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GV50	99 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PR80	420 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B6	O14756	317 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	NME2P1	O60361	137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SP1	P08047	785 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	NFYB	P25208	207 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	MKX	Q8IYA7	352 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	GAPT	Q8N292	157 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152		C9JQL5	133 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TGIF1	Q15583	401 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152		Q9N2K0	584 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BRF1-222	ENST00000635152	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CA6	P23280	308 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OMG	P23515	440 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	WNT5A	P41221	380 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	UCP3	P55916	312 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CLN3	Q13286	438 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM209B	Q5JX69	171 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	APLNR	P35414	380 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ARR3	P36575	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CLINT1	Q14677	625 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SEC11C	Q9BY50	192 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152		M0R296	226 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDL1	O75783	438 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IL18BP	O95998	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	NAPSA	O96009	420 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GLA	P06280	429 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	F2RL1	P55085	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GNMT	Q14749	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	BTNL8	Q6UX41	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GPR137B	O60478	399 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SNAPIN	O95295	136 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PRH1	P02810	166 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MIDN	Q504T8	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152		Q8NFD4	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PPT1	P50897	306 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.8 ms