RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 RPL12P30050 165 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 PMELP40967 661 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 MKXQ8IYA7 352 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.96■□□□□ 0.15
PDLIM4-201ENST00000253754 K7EPK0 472 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ERVS71-1P61550 626 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 OR52M1Q8NGK5 317 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 C18orf12Q96KH6 178 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM100Q9NV29 134 aa15.96■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 HS3ST1O14792 307 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LYZL6O75951 148 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM157CP0CG43 387 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 PLA2G5P39877 138 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.95■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV1-2P23083 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GNRHRP30968 328 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 UCP3P55916 312 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF141Q8WVD5 230 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 RDH5Q92781 318 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MARC2Q969Z3 335 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXL17Q9UF56 701 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 K7EM74 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHG3P01860 377 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SMCO1Q147U7 214 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MED12LQ86YW9 2145 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIB1Q96RU8 372 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 OPA3Q9H6K4 179 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GP6Q9HCN6 339 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LHX6Q9UPM6 363 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.94■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 GNG3P63215 75 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MPV17LQ2QL34 196 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC35G3Q8N808 338 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LRTM2Q8N967 370 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ERGIC1Q969X5 290 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TAAR6Q96RI8 345 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SYT3Q9BQG1 590 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 PIGMQ9H3S5 423 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 H7C1Q1 480 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MPPED1O15442 326 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM33P57088 247 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 LGI3Q8N145 548 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF175Q9Y473 711 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.93■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM77I1YAP6 450 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 DEFA5Q01523 94 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 Q6ZS49 121 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 WDR86Q86TI4 376 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF573Q86YE8 665 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 POM121Q96HA1 1249 aa15.92■□□□□ 0.14
PDLIM4-201ENST00000253754 OR51I2Q9H344 312 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms