RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 FGF14Q92915 247 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PR80 420 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 EML2O95834 649 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CD37P11049 281 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 GABRG2P18507 467 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NEURL2Q9BR09 285 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ATG101Q9BSB4 218 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LAMB2P55268 1798 aa14.71□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 IFNL4K9M1U5 179 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LHX9Q9NQ69 397 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 KLKB1P03952 638 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 HERPUD1Q15011 391 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 SYS1Q8N2H4 156 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PRD5 423 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PRF3 423 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PRM7 423 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PARP11Q9NR21 331 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TMEM218A2RU14 115 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 SOX15O60248 233 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 HAND1O96004 215 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 COL8A1P27658 744 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 STARD4Q96DR4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ADRB1P08588 477 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 G6PCP35575 357 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 MYLKQ15746 1914 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PTP4A1Q93096 173 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 IFITM5A6NNB3 132 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TFAP2AP05549 437 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 D2HGDHQ8N465 521 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 COMMD1Q8N668 190 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 EMDP50402 254 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NTNG2Q96CW9 530 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 RNF7Q9UBF6 113 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LINC01565O15544 149 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PRSS2P07478 247 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NQO2P16083 231 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PRSS12P56730 875 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 H3BP45 60 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.69□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 FCN1O00602 326 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 OR4E1P0C645 316 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 RAC3P60763 192 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 M0R143 59 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 LPAR6P43657 344 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CDC20Q12834 499 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 PRR14Q9BWN1 585 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 S1PR2O95136 353 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 KISS1Q15726 138 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 TEX261Q6UWH6 196 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 ATP5J2P56134 94 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 HYAL1Q12794 435 aa14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP13-201ENST00000263966 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.4 ms