RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf49	A4QMS7	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GPR31	O00270	319 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ABCD4	O14678	606 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB6	O14558	160 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FGF16	O43320	207 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA21	P01568	189 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HKR1	P10072	659 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152		K7EPK0	472 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LRP3	O75074	770 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DIRAS3	O95661	229 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM157C	P0CG43	387 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LYL1	P12980	280 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NAAA	Q02083	359 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	MALL	Q13021	153 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR8B8	Q15620	311 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RGCC	Q9H4X1	137 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CD79A	P11912	226 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LHX2	P50458	406 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR1C1	Q15619	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZPA2	131 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	AGPAT2	O15120	278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ADCYAP1	P18509	176 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NME2	P22392	152 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DTYMK	P23919	212 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ECI1	P42126	302 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HAAO	P46952	286 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	XRCC2	O43543	280 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD6	O75340	191 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ATG12	O94817	140 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	GPM6A	P51674	278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM100	Q9NV29	134 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP1	P28562	367 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN18	P56856	261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM33	P57088	247 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BRF1-222	ENST00000635152	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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