RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10C1Q96KK4 312 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 R4GN57 208 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A096LPE4 126 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PPZ6 126 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KNG1P01042 644 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRADP55042 308 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CALHM1Q8IU99 346 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POC1AQ8NBT0 407 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B8ZZF3 427 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDCD6O75340 191 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTL6AO96019 429 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-HP01893 362 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAAAQ02083 359 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF611Q8N823 705 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIME1Q9H400 295 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR160Q9UJ42 338 aa14.24□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCO1O75880 301 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PET100P0DJ07 73 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OPRM1P35372 400 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARR3P36575 388 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf50Q8WW18 174 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MEMO1Q9Y316 297 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC28Q96AY4 2481 aa14.23□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C5orf49A4QMS7 147 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNAB3O43448 404 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CST4P01036 141 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MALLQ13021 153 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAXEQ8NCW5 288 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DYRK2Q92630 601 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AQP10Q96PS8 301 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOXB5P09067 269 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD46P15529 392 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FUT3P21217 361 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCNOP22674 350 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDX4Q13162 271 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB32Q13637 225 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC10A1Q14973 349 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.22□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB1AP62820 205 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELP2Q6IA86 826 aa14.21□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRICD5Q6PL45 260 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms