RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 DVL1O14640 695 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TBX1O43435 398 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SULT1C4O75897 302 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LALBAP00709 142 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KNG1P01042 644 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KRT8P05787 483 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF19P17023 458 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ALDH3B2P48448 385 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 NPY4RP50391 375 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RAG2P55895 527 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SPHARQ15513 63 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TAF13Q15543 124 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CD276Q5ZPR3 534 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KRT77Q7Z794 578 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FCGR1BQ92637 280 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RORBQ92753 470 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PELI1Q96FA3 418 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ15Q99712 375 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 VCX3AQ9NNX9 186 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LRP12Q9Y561 859 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 A0A0U1RQK1 487 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF878C9JN71 531 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF254O75437 659 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LHBP01229 141 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-69P01742 117 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 IGHV4-59P01825 116 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TFF1P04155 84 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CRYBA1P05813 215 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 H2BFMP0C1H6 154 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CX3CR1P49238 355 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 DLX1P56177 255 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GMFBP60983 142 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FAM3AP98173 230 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 BLMHQ13867 455 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MED22Q15528 200 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ8Q15842 424 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LRRC29Q8WV35 223 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ST8SIA4Q92187 359 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OPALINQ96PE5 141 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CCL13Q99616 98 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MROQ9BYG7 248 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 NOX4Q9NPH5 578 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 BRD7Q9NPI1 651 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 BABAM2Q9NXR7 383 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 XRCC2O43543 280 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LIPFP07098 398 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SELLP14151 372 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PSMB9P28065 219 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 BPIFB3P59826 476 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ACSM1Q08AH1 577 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TIGD6Q17RP2 521 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MIDNQ504T8 468 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 WDR38Q5JTN6 314 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FAM57BQ71RH2 274 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SPERTQ8NA61 448 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms