RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	THBS2	P35442	1172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF81	P51508	661 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CAV3	P56539	151 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TPK1	Q9H3S4	243 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996		F5H5P2	479 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SOD3	P08294	240 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DANCR	P0C864	163 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	GPM6A	P51674	278 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	FUT6	P51993	359 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RNF170	Q96K19	258 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	MICU1	Q9BPX6	476 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996		V9GY05	133 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	NOTO	A8MTQ0	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CD8A	P01732	235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ADH4	P08319	380 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CD200	P41217	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	RBP2	P50120	134 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	PPOX	P50336	477 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ATP1B3	P54709	279 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	MTCP1	P56278	107 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	GNG3	P63215	75 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	KISS1	Q15726	138 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	IFITM5	A6NNB3	132 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	AIP	O00170	330 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SLC17A2	O00624	439 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CD55	P08174	381 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CD37	P11049	281 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TNFSF4	P23510	183 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	CFP	P27918	469 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	OR3A4P	P47883	348 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	PSMD7	P51665	324 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	ZP1	P60852	638 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RNF13-208	ENST00000467996	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8

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