RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFRSF14	Q92956	283 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF170	Q96K19	258 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	OR8B4	Q96RC9	309 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	SLITRK2	Q9H156	845 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51I2	Q9H344	312 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	ABCB9	Q9NP78	766 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	C1RL	Q9NZP8	487 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF222	Q9UK12	451 aa		9.84	□□□□□ -0.83
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GVI7	797 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZAR1L	A6NP61	321 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SIGLEC5	O15389	551 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	AKR7A2	O43488	359 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFA7	O95182	113 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV4-59	P01825	116 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GPM6A	P51674	278 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DLX1	P56177	255 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GMFB	P60983	142 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ESRRG	P62508	458 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	IKZF1	Q13422	519 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	C12orf73	Q69YU5	71 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZSR3	168 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KRT77	Q7Z794	578 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR37	O15354	613 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFB3	O43676	98 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF254	O75437	659 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TTR	P02766	147 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V1B1	P15313	513 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	FAH	P16930	419 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	IER3	P46695	156 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MAP2K3	P46734	347 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP10-3	P60369	221 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG3	P63215	75 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6AP1	Q15904	470 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CEP78	Q5JTW2	689 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	AQP3	Q92482	292 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ITFG2	Q969R8	447 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR84	Q9NQS5	396 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GTI1	187 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2AT4	A6NND4	320 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF732	B4DXR9	585 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR137B	O60478	399 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	PSG2	P11465	335 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RAG2	P55895	527 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	CAV3	P56539	151 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KLRD1	Q13241	179 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM42	Q69YG0	159 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	HCP5	Q6MZN7	132 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
PTPRF-211	ENST00000467464	SSX6	Q7RTT6	188 aa		9.81	□□□□□ -0.84

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