RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 MMP9P14780 707 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 WNT5AP41221 380 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 AGERQ15109 404 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GPX8Q8TED1 209 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 CMBLQ96DG6 245 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GINS3Q9BRX5 216 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 IL19Q9UHD0 177 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TLCD2A6NGC4 264 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 CEACAM1P13688 526 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 CLDN2P57739 230 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 HSD11B2P80365 405 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 DEFB103AP81534 67 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GRINAQ7Z429 371 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 IFI44Q8TCB0 444 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.49□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 STATHP02808 62 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GLIPR1P48060 266 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TMEM215Q68D42 235 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 FGF11Q92914 225 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 AQP10Q96PS8 301 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 A0A1W2PPC1 479 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ZNF264O43296 627 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 DNAJB6O75190 326 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 MPC1LP0DKB6 136 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PRPS1P60891 318 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 DIO2Q92813 273 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 VAX2Q9UIW0 290 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 FUT9Q9Y231 359 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 M0QZ24 198 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SLC16A5O15375 505 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 FUT3P21217 361 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ERVS71-1P61550 626 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 COL10A1Q03692 680 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 STPG1Q5TH74 334 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GKN2Q86XP6 184 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR4K15Q8NH41 348 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.48□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 K7ERU9 68 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GPR137BO60478 399 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SLC7A9P82251 487 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PRR27Q6MZM9 219 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR4X1Q8NH49 305 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 MSL2Q9HCI7 577 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 AK3Q9UIJ7 227 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TCFL5Q9UL49 500 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 EFSO43281 561 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 SERPINA4P29622 427 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 CCL26Q9Y258 94 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 ZFP92A6NM28 416 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 BTG2P78543 158 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PMPCAQ10713 525 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.47□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 A0A1B0GTH9 108 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 Q6ZN92 141 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.46□□□□□ -0.09
CBX8-201ENST00000269385 GLYATL1Q969I3 302 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms